基于对大数据平台的使用，医院已经开始向信息化的财务管理模式靠拢，但是由于种种因素，医院的财务报销模式仍然处于急待建设的状态，主要体现在以下几个方面。
（一）医院财务报销模式中的信息不够对称
报销人不了解报销标准及报销所需材料，不了解职能科室分工及审批流程，而且报销人无法查询报销进度。报销人仅在需要报销时向财务人员咨询，一边财务人员忙于解释报销制度，一边报销人不理解，报销人与财务人员之间存在误会与矛盾。
（二）医院智慧财务报销模式的建立向硬件建设过度倾斜
在一定程度上，医院激励智慧财务报销模式的目的在于医院资源的节约，但是，现在医院在智慧财务报销都将建设重点放在硬件投入上，随着硬件资金投入越来越多，久而久之，医院的硬件投入与效益不成正比，智慧财务报销体系功能无法发挥最大作用，容易造成资源浪费和缺失。
（三）医院智慧财务报销模式的安全需求过高
对于新型的财务报销模式，无疑对智慧财务报销模式的安全性提出了更高的要求。尽管智慧财务报销模式拥有相对独立的服务器，但是随着互联网技术的发达以及第三方医疗服务组织平台的介入，这种看似没有漏洞的信息保护系统也拥有数据泄露的危险。
（四）医院智慧财务报销模式在运营时未能发挥全部功能
医院智慧财务医院的成本、业务的会计核算工作，这种传统模式存在着高级运营方面的短板，这主要体现在两个方面，首先是信息流通的滞后，医院各个部门的软件应用来说，这种智慧财务报销模式仅仅是“锦上添花”，现在仍然没有实现“雪中送炭”的效果，原因就是信息对接的不灵活、不及时，医院智慧财务模式使用不当。
医院的管理并没有完全依靠智慧财务报销模式，无法达到全院的信息共通、资源共享，所以无论是医医院自身的运营管理，智慧财务报销模式都无法发挥其最大的作用。
（五）医院高层对智慧财务报销模式的支持度
由于智慧财务报销体系建设的烦琐复杂，需要投入的硬件、软件较多，医院的管理层没有深入了解过智慧财务报销模式，对其功能也仅仅是有模棱两可的认知，管理层对于智慧财务报销系统的资金投入和医院是否能够拥有一个健全的智慧财务报销模式。
同时管理层应号召各级部门重视该财务报销模式，通过智慧财务报销模式实现各级信息的协调，在最大程度上将智慧财务报销系统的作用发挥到最大。
（六）医院对智慧财务报销模式专业人才的缺失
医院财务部门的工作人员的专业相关有待提升，首先，医院财务部门的工作人在做好基本的、传统的财务工作的同时，还要掌握智慧财务报销的相关操作和知识，医院大部分的工作者依然用传统的财务报销模式工作，在智能化、数据化面前，他们的工作效率相对较低。
其次，由于对智慧财务报销模式的不了解，无法在日常的工作中总结经验，医院的智慧财务报销模式做有效的基础信息建设。最后，医院在智慧财务报销模式投入很大的成本购买相关硬件、软件之后，专业性工作人员的相对缺失，使得智慧财务报销模式无法发挥其最大的功效，医院的资源浪费。
结语大数据时代，医院在建立智慧财务报销模式时，仍然有很多程序需要探索，但是，医院智慧财务报销模式的高效运行、医疗服务水平的提升指日可待。